Một năm học mới đã bắt đầu tại Học viện Ayanagi đối với Yuuta Hoshitani và các thành viên của Đội Ootori. Khi buổi biểu diễn tốt nghiệp hàng năm của trường mang tên "Shadow and Lights" nhanh chóng đến gần, các năm thứ hai trong Khoa Âm nhạc phải tham gia sản xuất như một phần trong chương trình giảng dạy của họ.
Xem thêm
Phi Brain: Puzzle of God 3, Phi Brain: Kami no Puzzle Dai 3, Phi Brain: Kami no Puzzle Third Season, Phi Brain: Kami no Puzzle 3rd Season, Phi Brain: Puzzle of God - Nemesis! Raetsel-hen (2013)